Первым директором средней школы №5 Ткаченко Ю.П. было сформировано математическое направление обучения, раннее изучение иностранных языков, спортивный и музыкальный профили, изобразительное искусство.
В 1991 году созданы гимназические классы и классы выравнивания. С этого момента педагогический коллектив начал работать над проблемой "Дифференциация и индивидуализация обучения и воспитания учащихся". В школе работали многочисленные кружки и клубы по интересам. Прошел конкурс "Гимн пятой школы", на котором лучшим признан гимн на стихи Коцарева и музыку Марадудиной Л.Н.
20 октября 1992 года директором назначен Киреев В.А., работавший долгое время учителем русского и немецкого языка в средней школе №6, затем заведовавший гороно; в школе №5 начинал работу заместителем директора. Киреев, выступал инициатором литературных встреч с Молчановым В.Е., Череватенко В.Я., Кулижниковым М.А.. Школе были подарены книги В.Молчанова "Другие времена", М.Кулижникова "Пейзаж с вечерним городом", В. Череватенко "Любимые мои, хорошие".
С 1994 года (директор - Купина Т.И.) школа вступила в период адаптивной многопрофильной школы. Число учащихся - 1719 человек. Режим работы-двухсменный. Число учителей - 119 человек. Создана система коллективной творческой деятельности, направляет которую детская организация "Юное поколение России". Учащиеся активно участвовали в различных олимпиадах. С первых дней работы школы велась систематическая целенаправленная работа по созданию "Малой Третьяковки".
В феврале 1996 года в школе была открыта персональная выставка художника-земляка А.Ф.Лотышева при его личном участии; гостями школы с авторскими выставками-передвижками были художники-шебекинцы И.Колесов, Полозов, Чаленко.
В 1996 году школа стала победителем областного конкурса "Школа года".
С 1997-1998 учебного года обучение ведется с 5 класса. Педагогический коллектив поставил перед собой новую проблему: "Выявление и развитие способностей детей через организацию их творческой деятельности".
В 1998-1999 учебном году в 47 классах-комплектах обучалось около 1200 человек. В учебный план школы были включены областные компоненты: основы рыночной экономики, основы и ценности православия, компонент народное музыкальное творчество, краеведение, граждановедение, из истории религии, светочи России. Организована начальная профессиональная подготовка по специальностям: "Художник-декоратор", "Лаборант ЭВМ", "гид-переводчик(английский язык)", "швейное дело". Созданы кадетские классы. Разработана целевая программа "Одаренные дети".
В 1999 году школа награждена дипломом "Школа года-1999".
В июле 2000 года директором назначена Отличник народного просвещения Воротеляк В.С., длительное время работавшая заместителем директора по учебно-воспитательной работе. Учебный процесс осуществляют 74 педагога.
На начало 2000-2001 учебного года в школе насчитывалось 839 учащихся: на 2 ступени обучения-649, на 3-190. Это 35 классов-комплектов.
В 2002 году школа заняла 2 место по итогам социально-экономического развития общеобразовательных школ города, 3 место в смотре-конкурсе на лучшую постановку спортивно-массовой и культурно-оздоровительной работы.
2003 - школа - участник регионального конкурса «Школа года»
2006 – школа - победитель конкурса общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы (Приоритетный национальный проект «Образование», Министерство образования и науки РФ)
2006 - школа - победитель конкурса общеобразовательных учреждений, по благоустройству школьных территорий.
2008 – школа прошла аккредитацию на подтверждение статуса по типу: МОУ «Средняя общеобразовательная школа №5 с углубленным изучением отдельных предметов». (приказ №2402 от 28 ноября 2008 г. по Департаменту образования, культуры и молодежной политики Белгородской области)
2008 – Постановление №767 от 28.05.2008 главы администрации Шебекинского района, приказ по школе №380 от 02.06.2008 г. «Об открытии ступени начального общего образования в МОУ «СОШ №5 с УИОП г. Шебекино Белгородской области»
2008 – школа признана учреждением, прошедшим лицензирование на право осуществлять деятельность по общеобразовательным программам начального общего образования с нормативным сроком освоения 4 года. (Приказ №1738 от 03.09. 2008 г. По Департаменту образования, культуры и молодежной политики Белгородской области)
2008 - школа - победитель конкурса общеобразовательных учреждений, по благоустройству школьных территорий.
2010 – Приказ УО администрации Шебекинского района №1012 от 6 сентября 2010 г. «Об изменениях функционирования сети городского образовательного округа» утвержден статус школы как «Ресурсного центра по работе с одаренными детьми и методической работе»
2011 – Постановление №1088 от 01.08.2011 г. главы администрации Шебекинского района «Об изменении типа образовательного учреждения МОУ «СОШ №5 с УИОП г. Шебекино Белгородской области» на МБОУ «СОШ №5 с УИОП г. Шебекино Белгородской области»
2011 – Приказ Департамента образования, культуры и молодежной политики Белгородской области №3461 от 17 ноября 2011 г. «О приоритетных направлениях деятельности инновационных площадок в сфере образования Белгородской области на 2011-2012 учебные года школа определена региональной инновационной площадкой по работе с одаренными детьми
2012 – Победители межрегионального конкурса "Символика идеального государства". Лучший публичный доклад образовательного учреждения (сертификат БелИРО)
2013-2014 – Победители областного конкурса на лучшую постановку физкультурной работы и развития массового спорта среди школьных спортивных клубов
2015-2016 – Победители по итогам рейтингования в 2015 году среди школ "повышенного" уровня (приказ департамента Белгородской области от 28.12.2015 года №5322). свидетельство о занесении на Доску Почета Шебекинского района за высокие достижения в развитии и социальной сферы Шебекинского района за 2015 год (распоряжение администрации Шебекинского района от 18.04.2016 года № 301)
2016-2017 – Благодарность Федерации развития образования за постоянное внимание к вопросам развития образования (27.04.2017 год). Победители областного конкурса на лучшую постановку физкультурной работы и развития массового спорта среди школьных спортивных клубов (грамота департамента образования Белгородской области от 04.08.2017). Победители областного конкурса "Самый здоровый класс" (диплом департамента образования Белгородской области)
2019-2020 - МБОУ «Средняя общеобразовательная школа №5 с УИОП г. Шебекино Белгородской области» стала участником федерального проекта "Современная школа" национального проекта "Образование". Создание центра "Точка роста" на базе ОО органично вписалось в реализуемую региональную Стратегию «Доброжелательная школа». Открыт IT класс.
Первым директором средней школы №5 Ткаченко Ю.П. было сформировано математическое направление обучения, раннее изучение иностранных языков, спортивный и музыкальный профили, изобразительное искусство.